Me ha parecido interesante esta serie de comandos que logran sacar un árbol estructurado de todos los subdirectorios desde el punto en el que nos encontramos:

ls -R | grep ":$" | sed -e 's/:$//' -e 's/[^-][^\/]*\//--/g' -e 's/^/   /' -e 's/-/|/'

El resultado sería algo así:

  .
   |-bin
   |-etc
   |---gconf
   |-----schemas
   |-games
   |-include
   |---arpa
   |---asm
   |---asm-generic
   |---atk-1.0
   |-----atk
   |---bits
   |---c++
   |-----4.2
   |-------backward
   |-------bits
   |-------debug
   |-------ext
   |---------pb_ds
   |-----------detail
   |-------------basic_tree_policy
   |-------------binary_heap_
   |-------------binomial_heap_
   |-------------binomial_heap_base_
   |-------------bin_search_tree_
   |-------------cc_hash_table_map_
   |-------------eq_fn
   |-------------gp_hash_table_map_
   |-------------hash_fn
   |-------------left_child_next_sibling_heap_
   |-------------list_update_map_
   |-------------list_update_policy
   |-------------ov_tree_map_
   |-------------pairing_heap_
   |-------------pat_trie_
   |-------------rb_tree_map_
   |-------------rc_binomial_heap_
   |-------------resize_policy
   |-------------splay_tree_
   |-------------thin_heap_
   |-------------tree_policy
   |-------------trie_policy
   |-------------unordered_iterator
   |-------i486-linux-gnu
   |---------64
   |-----------bits
   |---------bits
--Más--

Vía | www.commandlinefu.com

Con la siguiente línea de comandos, lograremos eliminar todos los directorios que estén vacíos a partir de el directorio en el que nos encontremos (.):

find . -type d -empty -print0 | xargs -0 rmdir

La explicación es sencilla, usamos find para buscar, le indicamos que queremos buscar directorios (-type d), que estén vacíos (-empty), y los mostramos por pantalla (print), posteriormente, al resultado de este comando le pasamos la orden de borrado de directorio usando Xargs.